高等教育自学考试本科和函授本科的区别在于报名条件，考试方式不同，自考每年考生可以报考两次，函授每年考生可以报考一次。
报考条件不同
自学考试不受性别、年龄、民族、种族和已受教育程度的限制，均可参加自学考试。
报考函授高起本的考生应具有高中文化程度；报考函授专升本的考生必须是已取得经教育部审定核准的国民教育系列高等学校、高等教育自学考试机构颁发的专科毕业证书、本科肄业证书或以上证书的人员。
考试方式不同
现在一般所说的函授本科指的是成教本科。学生只有通过国家统一的成人高考考试，才能入学就读。
自考本科没有入学考试，报名之后就可以入学就读。
考试时间不同
函授本科全国统一的招生入学考试一般安排在10月，一年仅有一次考试的机会。
自考本科是每年在4月和10月考试，有的地区是1月、4月、7月、10月四次考试，有的地区是1月、4月、10月三次考试。各省地区的考试时间规定是不同的。
证书不同
函授是成人高考的一种方式，自考和成考是学历提升的两种方式，自考和成考都是一样的，但是两者颁发证书是有些区别的，比如函授本科毕业证书会有“成人高考”的字样，函授本科考上哪个学校毕业证就会加盖哪个学校的章。而自考本科毕业证书需要有“自考”字样，加盖两个章，一个是主考院校的章，另一个是当地自考委的章。
自学考试招生专业众多，例如：法学、工商管理、行政管理、会计学、汉语言学、金融学、物流管理、财务管理、学前教育、小学教育、城市轨道交通运营管理、建筑工程技术、建设工程管理、工厂造价等等。
报考自学考试为10-15门左右，考生可以根据个人的兴趣、爱好、职业发展进行选择专业，也可以根据自身的基础选择专业，减轻考试难度。
