自考本科和函授本科均属于非全日制学历，为第二学历，含金量较高。主要区别体现在报考条件不同、报考时间不同、考试方式不同、学习方式不同、学制不同、毕业形式不同。
主要区别体现在：
1、报考条件不同
函授专升本报考考生需要具有高中或专科及以上学历。自考专升本报考没有前置学历要求，但是毕业时需要出具专科或者以上学历证书。
2、报考时间不同
函授专升本一般8-9月完成网上志愿填报报名，9月确认，10月末参加全国统一的入学资格考试。自考本科考试时间是每年4月和10月，报名时间是在考试前的一个月左右。
3、考试方式不同
函授专升本需要参加全国统一考试。自考专升本没有入学考试，为学分制，考过一门办法一门证书，全部通过后可以申请毕业。
4、学习方式不同
函授专升本以自学为主、集中面授为辅的教学方式，自考专升本需要完全自主学习。
5、学制不同
函授专升本学制一般为2.5-3年，自考专升本无学制要求。
6、毕业形式不同
函授专升本毕业以后可以得到成人教育毕业证书，也可以直接申请学历证书。自考专升本则需要在完成专业规定的课程后，方可递交学历证书的申请证明。
函授专升本和自考专升本的毕业证文凭均为非全日制本科学历，属于第二学历，属于国民教育。受国家承认，可以在学信网上查询学籍。
函授和自考的毕业证含金量都是较高的，享受普通高校相同学历层次毕业生同等待遇。
函授专升本和自考本科的毕业生毕业后均可申请留学，考编，考公，考研。对于以后的晋升还是有很大作用的。
自考专升本毕业难度略高于函授专升本一点。自考专升本宽进严出，入学门槛较低但是考试科目较多，在职人员在复习方面可能会有些吃力。函授专升本严进宽出，入学后只需要完成期末考试合格即可。考生可以根据自身情况来选择函授专升本和自考专升本的考试。
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