专本贯通和本科在学制、起点、入学方式、报考条件等方面有所不同。专本贯通即统招专升本，也是专接本，学制为5年，前3年在专科院校学习，后2年在本科院校学习;本科即统招本科，一般学制为4年，医学类、建筑类专业学制为5年。
起点不同
专本贯通的起点为高职专科层次，学生先在专科院校学习，再通过转段考试进入本科院校学习；本科的起点一般为高中应往届毕业生，直接进入本科学习。
入学方式不同
专本贯通的入学由各省考试院组织实施安排，考试时间不相同；本科的入学统一安排，各省市具体实施，考试时间统一。
考试科目不同
专本贯通的考试科目包括大学语文/高等数学、大学英语、思想政治、计算机应用基础和专业综合课程等；本科的入学考试主要是高考规定的科目，与各省实施的新高考方案有关。
学制不同
专本贯通即统招专升本，学制通常为5年，前3年在专科院校学习，后2年在本科院校学习；本科的学制一般为4年，部分专业如医学类和建筑类的学制为5年。
毕业证不同
专本贯通的学生最终获得的是专科起点的本科毕业证，可能会注明“两年制”；普通本科毕业生获得的是完整的四年制本科毕业证和学位证。
