报考次数不同：自学考试每年可以报考两次，成人高考函授每年可以报考一次。学制不同：自学考试没有学制的限制，考生几年完成专业课程几年可以申请毕业，成人高考函授专升本最短学制为2.5年。
入学考试不同
函授专升本都必须要通过成人高中教育，在拿到相关的毕业证书以后还需要被学校的继续教育学院所录取，因此入学方面有一定的要求，但如果是自考本科的话，则一般没有入学考试的要求，考生完全是自力更新，直接学习即可。
学习方法不同
函授专升本多数以面授的形式出现，而且必须要学校组织学习和考试，但是自考的话是完全通过个人努力来完成学业的。
报考条件不同
自考本科报考没有前置学历要求，但是在毕业时需要交付专科证明才可以获得本科证书；函授本科报考需要具有国家认可的大专学历可以报考专升本。
